Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTOP1Q7RTM1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms