Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDZRN4Q6ZMN7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms