Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M3

LLGL2, Lethal(2) giant larvae protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL2Q6P1M3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LLGL2Q6P1M3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LLGL2Q6P1M3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LLGL2Q6P1M3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LLGL2Q6P1M3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LLGL2Q6P1M3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LLGL2Q6P1M3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LLGL2Q6P1M3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LLGL2Q6P1M3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LLGL2Q6P1M3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LLGL2Q6P1M3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LLGL2Q6P1M3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LLGL2Q6P1M3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LLGL2Q6P1M3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms