Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms