Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC178Q5BJE1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms