Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CEP55Q53EZ4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP55Q53EZ4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms