Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYPL1Q16563 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms