Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F4Q16254 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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