Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USF2Q15853 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USF2Q15853 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USF2Q15853 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USF2Q15853 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USF2Q15853 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USF2Q15853 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USF2Q15853 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USF2Q15853 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USF2Q15853 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USF2Q15853 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USF2Q15853 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USF2Q15853 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USF2Q15853 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USF2Q15853 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USF2Q15853 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USF2Q15853 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USF2Q15853 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USF2Q15853 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USF2Q15853 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USF2Q15853 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USF2Q15853 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USF2Q15853 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USF2Q15853 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USF2Q15853 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USF2Q15853 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USF2Q15853 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USF2Q15853 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
USF2Q15853 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USF2Q15853 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USF2Q15853 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USF2Q15853 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USF2Q15853 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USF2Q15853 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USF2Q15853 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USF2Q15853 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USF2Q15853 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USF2Q15853 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USF2Q15853 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USF2Q15853 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USF2Q15853 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USF2Q15853 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USF2Q15853 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USF2Q15853 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USF2Q15853 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USF2Q15853 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USF2Q15853 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USF2Q15853 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
USF2Q15853 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USF2Q15853 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USF2Q15853 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USF2Q15853 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USF2Q15853 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USF2Q15853 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USF2Q15853 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USF2Q15853 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USF2Q15853 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USF2Q15853 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USF2Q15853 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USF2Q15853 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USF2Q15853 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USF2Q15853 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USF2Q15853 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USF2Q15853 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
USF2Q15853 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
USF2Q15853 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USF2Q15853 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USF2Q15853 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USF2Q15853 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USF2Q15853 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USF2Q15853 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USF2Q15853 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USF2Q15853 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USF2Q15853 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USF2Q15853 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USF2Q15853 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USF2Q15853 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USF2Q15853 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
USF2Q15853 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USF2Q15853 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USF2Q15853 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USF2Q15853 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USF2Q15853 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USF2Q15853 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USF2Q15853 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USF2Q15853 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USF2Q15853 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USF2Q15853 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USF2Q15853 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USF2Q15853 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USF2Q15853 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USF2Q15853 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USF2Q15853 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USF2Q15853 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USF2Q15853 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USF2Q15853 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USF2Q15853 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USF2Q15853 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USF2Q15853 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USF2Q15853 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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