Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RABEP1Q15276 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
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