Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms