Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATMQ13315 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATMQ13315 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATMQ13315 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATMQ13315 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATMQ13315 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATMQ13315 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATMQ13315 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATMQ13315 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATMQ13315 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATMQ13315 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATMQ13315 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATMQ13315 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATMQ13315 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATMQ13315 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATMQ13315 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATMQ13315 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATMQ13315 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATMQ13315 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATMQ13315 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATMQ13315 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATMQ13315 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATMQ13315 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATMQ13315 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATMQ13315 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATMQ13315 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATMQ13315 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATMQ13315 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATMQ13315 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATMQ13315 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATMQ13315 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATMQ13315 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATMQ13315 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATMQ13315 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATMQ13315 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATMQ13315 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATMQ13315 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATMQ13315 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATMQ13315 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATMQ13315 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATMQ13315 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATMQ13315 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATMQ13315 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATMQ13315 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATMQ13315 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATMQ13315 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATMQ13315 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATMQ13315 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATMQ13315 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATMQ13315 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATMQ13315 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ATMQ13315 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATMQ13315 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATMQ13315 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATMQ13315 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATMQ13315 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ATMQ13315 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATMQ13315 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATMQ13315 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATMQ13315 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATMQ13315 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATMQ13315 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATMQ13315 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATMQ13315 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATMQ13315 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATMQ13315 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATMQ13315 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATMQ13315 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATMQ13315 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATMQ13315 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATMQ13315 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATMQ13315 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ATMQ13315 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ATMQ13315 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATMQ13315 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATMQ13315 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATMQ13315 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ATMQ13315 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ATMQ13315 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATMQ13315 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATMQ13315 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATMQ13315 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATMQ13315 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATMQ13315 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATMQ13315 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATMQ13315 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATMQ13315 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATMQ13315 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATMQ13315 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATMQ13315 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATMQ13315 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATMQ13315 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATMQ13315 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATMQ13315 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATMQ13315 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATMQ13315 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ATMQ13315 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATMQ13315 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATMQ13315 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ATMQ13315 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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