Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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ERCC8Q13216 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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ERCC8Q13216 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ERCC8Q13216 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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