Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ASIC1P78348 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ASIC1P78348 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ASIC1P78348 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ASIC1P78348 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ASIC1P78348 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ASIC1P78348 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ASIC1P78348 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ASIC1P78348 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ASIC1P78348 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ASIC1P78348 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ASIC1P78348 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ASIC1P78348 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ASIC1P78348 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ASIC1P78348 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ASIC1P78348 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ASIC1P78348 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ASIC1P78348 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ASIC1P78348 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ASIC1P78348 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ASIC1P78348 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ASIC1P78348 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ASIC1P78348 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ASIC1P78348 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ASIC1P78348 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ASIC1P78348 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ASIC1P78348 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ASIC1P78348 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ASIC1P78348 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ASIC1P78348 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ASIC1P78348 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ASIC1P78348 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ASIC1P78348 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ASIC1P78348 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ASIC1P78348 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ASIC1P78348 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms