Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms