Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms