Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPT1P50897 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPT1P50897 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPT1P50897 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPT1P50897 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPT1P50897 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPT1P50897 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPT1P50897 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPT1P50897 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPT1P50897 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPT1P50897 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPT1P50897 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPT1P50897 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPT1P50897 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPT1P50897 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPT1P50897 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPT1P50897 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPT1P50897 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPT1P50897 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPT1P50897 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPT1P50897 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPT1P50897 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPT1P50897 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPT1P50897 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPT1P50897 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPT1P50897 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPT1P50897 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPT1P50897 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPT1P50897 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPT1P50897 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPT1P50897 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPT1P50897 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPT1P50897 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPT1P50897 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPT1P50897 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPT1P50897 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPT1P50897 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPT1P50897 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPT1P50897 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPT1P50897 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPT1P50897 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPT1P50897 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPT1P50897 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPT1P50897 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPT1P50897 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPT1P50897 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPT1P50897 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPT1P50897 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPT1P50897 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPT1P50897 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPT1P50897 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPT1P50897 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPT1P50897 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPT1P50897 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPT1P50897 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms