Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPFP49454 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPFP49454 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPFP49454 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPFP49454 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPFP49454 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPFP49454 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPFP49454 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPFP49454 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPFP49454 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPFP49454 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPFP49454 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPFP49454 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPFP49454 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPFP49454 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPFP49454 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPFP49454 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPFP49454 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPFP49454 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPFP49454 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPFP49454 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPFP49454 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPFP49454 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPFP49454 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPFP49454 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPFP49454 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPFP49454 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPFP49454 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPFP49454 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPFP49454 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPFP49454 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPFP49454 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPFP49454 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPFP49454 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPFP49454 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPFP49454 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPFP49454 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPFP49454 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPFP49454 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPFP49454 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPFP49454 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPFP49454 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPFP49454 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPFP49454 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPFP49454 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPFP49454 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPFP49454 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPFP49454 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPFP49454 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPFP49454 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPFP49454 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPFP49454 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPFP49454 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPFP49454 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPFP49454 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPFP49454 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPFP49454 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPFP49454 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPFP49454 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPFP49454 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPFP49454 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPFP49454 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPFP49454 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPFP49454 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPFP49454 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPFP49454 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPFP49454 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPFP49454 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPFP49454 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPFP49454 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPFP49454 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPFP49454 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPFP49454 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPFP49454 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPFP49454 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPFP49454 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPFP49454 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPFP49454 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPFP49454 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPFP49454 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPFP49454 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPFP49454 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPFP49454 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPFP49454 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPFP49454 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPFP49454 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPFP49454 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPFP49454 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPFP49454 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPFP49454 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPFP49454 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPFP49454 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPFP49454 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPFP49454 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPFP49454 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPFP49454 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPFP49454 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPFP49454 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPFP49454 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPFP49454 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms