Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCAP37840 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCAP37840 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCAP37840 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCAP37840 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCAP37840 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCAP37840 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCAP37840 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCAP37840 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCAP37840 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCAP37840 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCAP37840 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCAP37840 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCAP37840 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCAP37840 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCAP37840 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCAP37840 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCAP37840 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCAP37840 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCAP37840 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCAP37840 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCAP37840 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNCAP37840 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNCAP37840 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNCAP37840 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNCAP37840 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNCAP37840 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNCAP37840 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNCAP37840 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNCAP37840 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNCAP37840 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNCAP37840 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNCAP37840 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNCAP37840 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNCAP37840 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNCAP37840 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNCAP37840 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SNCAP37840 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SNCAP37840 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNCAP37840 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNCAP37840 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNCAP37840 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNCAP37840 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNCAP37840 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNCAP37840 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNCAP37840 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNCAP37840 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNCAP37840 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNCAP37840 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNCAP37840 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNCAP37840 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNCAP37840 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNCAP37840 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNCAP37840 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNCAP37840 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNCAP37840 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNCAP37840 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNCAP37840 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNCAP37840 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNCAP37840 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNCAP37840 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNCAP37840 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNCAP37840 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNCAP37840 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNCAP37840 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNCAP37840 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNCAP37840 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNCAP37840 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNCAP37840 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNCAP37840 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNCAP37840 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SNCAP37840 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNCAP37840 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNCAP37840 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNCAP37840 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNCAP37840 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNCAP37840 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNCAP37840 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNCAP37840 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNCAP37840 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNCAP37840 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNCAP37840 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNCAP37840 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNCAP37840 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNCAP37840 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNCAP37840 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNCAP37840 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNCAP37840 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNCAP37840 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNCAP37840 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNCAP37840 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNCAP37840 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNCAP37840 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNCAP37840 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNCAP37840 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNCAP37840 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNCAP37840 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNCAP37840 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNCAP37840 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNCAP37840 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms