Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms