Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms