Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms