Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM21P19474 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms