Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA1P15085 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA1P15085 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA1P15085 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA1P15085 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA1P15085 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA1P15085 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA1P15085 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA1P15085 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA1P15085 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA1P15085 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA1P15085 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA1P15085 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA1P15085 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA1P15085 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA1P15085 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CPA1P15085 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CPA1P15085 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA1P15085 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA1P15085 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA1P15085 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA1P15085 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA1P15085 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA1P15085 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA1P15085 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA1P15085 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA1P15085 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA1P15085 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA1P15085 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA1P15085 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA1P15085 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA1P15085 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA1P15085 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA1P15085 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA1P15085 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA1P15085 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA1P15085 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA1P15085 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA1P15085 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA1P15085 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA1P15085 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA1P15085 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA1P15085 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA1P15085 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA1P15085 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA1P15085 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA1P15085 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA1P15085 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA1P15085 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA1P15085 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA1P15085 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA1P15085 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA1P15085 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA1P15085 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA1P15085 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA1P15085 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA1P15085 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA1P15085 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA1P15085 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA1P15085 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA1P15085 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA1P15085 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA1P15085 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA1P15085 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA1P15085 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA1P15085 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA1P15085 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA1P15085 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA1P15085 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA1P15085 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA1P15085 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA1P15085 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA1P15085 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA1P15085 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA1P15085 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA1P15085 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA1P15085 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA1P15085 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA1P15085 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA1P15085 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA1P15085 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA1P15085 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA1P15085 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA1P15085 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA1P15085 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA1P15085 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA1P15085 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA1P15085 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA1P15085 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA1P15085 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA1P15085 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA1P15085 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA1P15085 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA1P15085 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA1P15085 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA1P15085 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA1P15085 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA1P15085 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA1P15085 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA1P15085 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms