Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA4P13612 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms