Protein–RNA interactions for Protein: P09341

CXCL1, Growth-regulated alpha protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL1P09341 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL1P09341 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms