Protein–RNA interactions for Protein: P08195

SLC3A2, 4F2 cell-surface antigen heavy chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A2P08195 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC3A2P08195 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC3A2P08195 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC3A2P08195 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC3A2P08195 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC3A2P08195 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC3A2P08195 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC3A2P08195 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC3A2P08195 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC3A2P08195 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC3A2P08195 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC3A2P08195 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC3A2P08195 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC3A2P08195 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC3A2P08195 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC3A2P08195 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC3A2P08195 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC3A2P08195 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC3A2P08195 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC3A2P08195 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC3A2P08195 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC3A2P08195 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC3A2P08195 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC3A2P08195 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC3A2P08195 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC3A2P08195 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC3A2P08195 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC3A2P08195 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC3A2P08195 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC3A2P08195 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC3A2P08195 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC3A2P08195 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC3A2P08195 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC3A2P08195 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC3A2P08195 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC3A2P08195 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC3A2P08195 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC3A2P08195 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC3A2P08195 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC3A2P08195 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC3A2P08195 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC3A2P08195 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC3A2P08195 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC3A2P08195 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms