Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN5O75503 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN5O75503 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN5O75503 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN5O75503 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN5O75503 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN5O75503 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN5O75503 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN5O75503 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN5O75503 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN5O75503 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN5O75503 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN5O75503 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN5O75503 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN5O75503 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN5O75503 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN5O75503 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLN5O75503 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLN5O75503 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLN5O75503 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLN5O75503 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN5O75503 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN5O75503 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN5O75503 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN5O75503 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN5O75503 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN5O75503 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN5O75503 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN5O75503 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN5O75503 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN5O75503 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN5O75503 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN5O75503 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN5O75503 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN5O75503 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN5O75503 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN5O75503 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN5O75503 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN5O75503 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN5O75503 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN5O75503 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN5O75503 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN5O75503 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN5O75503 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN5O75503 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN5O75503 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN5O75503 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN5O75503 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN5O75503 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN5O75503 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN5O75503 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN5O75503 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN5O75503 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN5O75503 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN5O75503 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN5O75503 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN5O75503 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN5O75503 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN5O75503 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN5O75503 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN5O75503 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN5O75503 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN5O75503 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN5O75503 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN5O75503 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN5O75503 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN5O75503 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN5O75503 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN5O75503 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN5O75503 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN5O75503 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN5O75503 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN5O75503 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN5O75503 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN5O75503 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN5O75503 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN5O75503 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN5O75503 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN5O75503 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN5O75503 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN5O75503 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN5O75503 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN5O75503 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN5O75503 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN5O75503 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN5O75503 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN5O75503 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN5O75503 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN5O75503 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN5O75503 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN5O75503 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN5O75503 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN5O75503 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN5O75503 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN5O75503 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN5O75503 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN5O75503 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN5O75503 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN5O75503 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN5O75503 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms