Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRODHO43272 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRODHO43272 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRODHO43272 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRODHO43272 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRODHO43272 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRODHO43272 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRODHO43272 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRODHO43272 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRODHO43272 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRODHO43272 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRODHO43272 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRODHO43272 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRODHO43272 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRODHO43272 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRODHO43272 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRODHO43272 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRODHO43272 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRODHO43272 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRODHO43272 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRODHO43272 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRODHO43272 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRODHO43272 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRODHO43272 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRODHO43272 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRODHO43272 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRODHO43272 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRODHO43272 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRODHO43272 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRODHO43272 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRODHO43272 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRODHO43272 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRODHO43272 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRODHO43272 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRODHO43272 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRODHO43272 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRODHO43272 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRODHO43272 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PRODHO43272 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRODHO43272 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRODHO43272 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRODHO43272 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRODHO43272 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRODHO43272 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRODHO43272 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRODHO43272 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRODHO43272 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRODHO43272 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRODHO43272 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRODHO43272 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRODHO43272 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRODHO43272 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRODHO43272 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRODHO43272 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRODHO43272 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRODHO43272 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRODHO43272 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRODHO43272 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRODHO43272 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PRODHO43272 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRODHO43272 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PRODHO43272 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRODHO43272 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRODHO43272 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRODHO43272 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PRODHO43272 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRODHO43272 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRODHO43272 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRODHO43272 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRODHO43272 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRODHO43272 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRODHO43272 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRODHO43272 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRODHO43272 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRODHO43272 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRODHO43272 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRODHO43272 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRODHO43272 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRODHO43272 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRODHO43272 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PRODHO43272 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRODHO43272 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRODHO43272 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRODHO43272 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PRODHO43272 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRODHO43272 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRODHO43272 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRODHO43272 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRODHO43272 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRODHO43272 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRODHO43272 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRODHO43272 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRODHO43272 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRODHO43272 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRODHO43272 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRODHO43272 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRODHO43272 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRODHO43272 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRODHO43272 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRODHO43272 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms