Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PODXLO00592 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PODXLO00592 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PODXLO00592 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PODXLO00592 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PODXLO00592 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PODXLO00592 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PODXLO00592 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PODXLO00592 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PODXLO00592 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PODXLO00592 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PODXLO00592 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PODXLO00592 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PODXLO00592 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PODXLO00592 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PODXLO00592 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PODXLO00592 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PODXLO00592 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PODXLO00592 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PODXLO00592 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PODXLO00592 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PODXLO00592 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PODXLO00592 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PODXLO00592 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PODXLO00592 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PODXLO00592 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PODXLO00592 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PODXLO00592 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PODXLO00592 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PODXLO00592 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PODXLO00592 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PODXLO00592 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PODXLO00592 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PODXLO00592 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PODXLO00592 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PODXLO00592 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PODXLO00592 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PODXLO00592 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PODXLO00592 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PODXLO00592 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PODXLO00592 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PODXLO00592 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PODXLO00592 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PODXLO00592 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PODXLO00592 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PODXLO00592 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PODXLO00592 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PODXLO00592 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PODXLO00592 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PODXLO00592 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PODXLO00592 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PODXLO00592 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PODXLO00592 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PODXLO00592 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PODXLO00592 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PODXLO00592 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PODXLO00592 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PODXLO00592 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PODXLO00592 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PODXLO00592 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PODXLO00592 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PODXLO00592 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PODXLO00592 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PODXLO00592 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PODXLO00592 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PODXLO00592 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PODXLO00592 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PODXLO00592 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PODXLO00592 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PODXLO00592 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PODXLO00592 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PODXLO00592 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PODXLO00592 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PODXLO00592 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PODXLO00592 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PODXLO00592 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PODXLO00592 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PODXLO00592 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PODXLO00592 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PODXLO00592 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PODXLO00592 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PODXLO00592 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PODXLO00592 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PODXLO00592 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PODXLO00592 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PODXLO00592 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PODXLO00592 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PODXLO00592 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PODXLO00592 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PODXLO00592 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PODXLO00592 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PODXLO00592 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PODXLO00592 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PODXLO00592 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PODXLO00592 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PODXLO00592 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PODXLO00592 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PODXLO00592 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PODXLO00592 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PODXLO00592 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms