Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms