Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYT5

KRTAP2-2, Keratin-associated protein 2-2, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-2Q9BYT5 TRAK1-202ENST00000341421 4620 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 PTCH1-205ENST00000418258 7815 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 TCF4-276ENST00000635822 7805 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 SMG6-201ENST00000263073 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 MIR4697HG-201ENST00000624667 5164 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 PTGFR-202ENST00000370757 4379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 MST1R-202ENST00000344206 4198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 HERC2P4-205ENST00000566902 3957 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 SH2D4A-201ENST00000265807 3352 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 C4orf46-202ENST00000508457 3358 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 ORC1-202ENST00000371568 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 EMC3-201ENST00000245046 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 SCN5A-209ENST00000451551 8343 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 AGPAT4-203ENST00000366911 7705 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 DHX37-206ENST00000544745 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 SCARA3-201ENST00000301904 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 AC010422.6-201ENST00000593682 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 ZNF565-202ENST00000355114 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 ARAP1-205ENST00000426523 4066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 B3GALT5-204ENST00000398714 2341 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 LRRC55-201ENST00000497933 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 REV3L-201ENST00000358835 10815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 VRTN-201ENST00000256362 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 TNFRSF9-204ENST00000615230 5970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 CHCHD5-202ENST00000409719 3272 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 UNC45A-202ENST00000418476 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 EIF4A2-201ENST00000323963 1919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 PRRC2C-203ENST00000392078 1919 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 YWHAZ-207ENST00000395958 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 MYO7B-203ENST00000428314 6715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 NCL-201ENST00000322723 4034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 HMMR-201ENST00000353866 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 BCL2L13-213ENST00000538149 4797 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 FHL1-201ENST00000345434 2458 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 AC068733.1-202ENST00000531479 2456 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 ELP4-212ENST00000638764 2456 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 NOL10-205ENST00000538384 3418 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 PLEKHB2-208ENST00000439822 4177 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 LRRC7-204ENST00000415775 3996 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 SPEF2-201ENST00000282469 3026 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 PRNT-203ENST00000423718 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 KLF6-207ENST00000542957 4537 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 SALL1-202ENST00000440970 5253 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 FAM86EP-201ENST00000313946 2845 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 GPR26-201ENST00000284674 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 CD59-203ENST00000415002 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 SERPINH1-202ENST00000524558 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 RHBDL3-201ENST00000269051 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 HAP1-203ENST00000347901 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 MSH6-201ENST00000234420 7476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 CPSF3-202ENST00000460593 3157 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 FAM13A-212ENST00000508369 3169 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 SHANK2-201ENST00000338508 7271 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 HCG18-236ENST00000438412 2440 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 SYNPO-202ENST00000394243 7063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 SLC22A14-201ENST00000273173 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 RPS6KB1-201ENST00000225577 5375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 IGSF9B-201ENST00000321016 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 PPP2R2C-202ENST00000335585 4092 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 FGFR1OP2-202ENST00000327214 2790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 PDCD11-201ENST00000369797 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 UGDH-AS1-201ENST00000504032 2787 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 REEP1-201ENST00000165698 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 CDK14-202ENST00000380050 4995 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 CHORDC1-202ENST00000457199 2003 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 SP110-215ENST00000540870 2032 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 NECAP1-201ENST00000339754 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 DNAJA2-201ENST00000317089 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 WWP2-213ENST00000568684 3672 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 TEX14-202ENST00000349033 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 PHACTR1-201ENST00000332995 5332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 ZEB2-234ENST00000636413 8984 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 GPATCH1-201ENST00000170564 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 SIPA1L2-202ENST00000308942 2937 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 TUFT1-204ENST00000392712 2946 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 NIPAL3-201ENST00000003912 5481 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 RN7SKP118-201ENST00000364331 330 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 IGLV5-52-201ENST00000390289 379 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 RPL9P21-201ENST00000392269 505 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP2-2Q9BYT5 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms