Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AP005139.1-201ENST00000580702 1647 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 CLEC3A-201ENST00000299642 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 SMG1P4-203ENST00000517529 1589 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 CDH17-203ENST00000450165 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 FGD4-202ENST00000427716 8242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 ZNF549-204ENST00000602149 5505 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 TATDN2P3-201ENST00000452855 3665 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 ZNF438-208ENST00000538351 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 IL1B-201ENST00000263341 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 FTH1P20-201ENST00000434913 548 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
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PTPRAP18433 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
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PTPRAP18433 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
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PTPRAP18433 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
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PTPRAP18433 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 MAPK10-298ENST00000641297 3040 ntAPPRIS P2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 RBFOX2-205ENST00000405409 6932 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
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PTPRAP18433 KLHL32-207ENST00000620278 2642 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
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PTPRAP18433 ZNFX1-202ENST00000371752 7212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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PTPRAP18433 AL359694.2-201ENST00000567753 1615 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 CCR2-204ENST00000445132 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 SMG1-210ENST00000565224 2372 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 LINC02035-201ENST00000610128 5476 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
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