Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CXCR1-201ENST00000295683 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CEP41-201ENST00000223208 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM46-201ENST00000334634 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PKD2L1-201ENST00000318222 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CUX1-206ENST00000437600 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AL031118.1-201ENST00000607727 2955 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF319-201ENST00000299237 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AL158212.3-201ENST00000564352 4237 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 NFYB-201ENST00000240055 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 NOL12-201ENST00000359114 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ACKR2-202ENST00000442925 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TCF7-203ENST00000395023 2815 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CLDN18-202ENST00000343735 3434 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 OSBPL6-206ENST00000409045 3427 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 HYOU1-221ENST00000621959 3358 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC11A2-201ENST00000262051 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PLSCR4-201ENST00000354952 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC24A1-203ENST00000399033 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 GRB10-202ENST00000357271 2050 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SFMBT2-201ENST00000361972 7922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RGS4-203ENST00000367909 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 DAPK2-201ENST00000261891 2603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TNPO1-213ENST00000523768 2632 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 NBPF3-203ENST00000342104 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ZBTB18-202ENST00000622512 3740 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFP1-203ENST00000464850 3067 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNG3-201ENST00000005284 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AIG1-209ENST00000629020 3636 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1F-202ENST00000376251 5813 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FKBP4P7-201ENST00000433874 1363 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA0040-203ENST00000545251 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 VSTM5-202ENST00000409977 2969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms