Protein–RNA interactions for Protein: V9GYQ6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYQ6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
V9GYQ6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
V9GYQ6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
V9GYQ6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
V9GYQ6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
V9GYQ6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
V9GYQ6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
V9GYQ6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
V9GYQ6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
V9GYQ6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
V9GYQ6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
V9GYQ6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
V9GYQ6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
V9GYQ6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
V9GYQ6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
V9GYQ6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
V9GYQ6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
V9GYQ6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
V9GYQ6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
V9GYQ6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
V9GYQ6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
V9GYQ6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
V9GYQ6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
V9GYQ6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
V9GYQ6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
V9GYQ6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
V9GYQ6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
V9GYQ6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
V9GYQ6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
V9GYQ6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
V9GYQ6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
V9GYQ6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
V9GYQ6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
V9GYQ6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
V9GYQ6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
V9GYQ6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
V9GYQ6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
V9GYQ6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
V9GYQ6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
V9GYQ6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
V9GYQ6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
V9GYQ6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
V9GYQ6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
V9GYQ6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
V9GYQ6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
V9GYQ6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
V9GYQ6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
V9GYQ6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
V9GYQ6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
V9GYQ6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
V9GYQ6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
V9GYQ6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
V9GYQ6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
V9GYQ6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
V9GYQ6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
V9GYQ6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
V9GYQ6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
V9GYQ6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
V9GYQ6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
V9GYQ6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
V9GYQ6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
V9GYQ6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
V9GYQ6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
V9GYQ6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
V9GYQ6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
V9GYQ6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
V9GYQ6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
V9GYQ6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
V9GYQ6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
V9GYQ6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
V9GYQ6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
V9GYQ6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
V9GYQ6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
V9GYQ6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
V9GYQ6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
V9GYQ6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
V9GYQ6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
V9GYQ6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
V9GYQ6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
V9GYQ6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
V9GYQ6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
V9GYQ6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
V9GYQ6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
V9GYQ6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
V9GYQ6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
V9GYQ6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
V9GYQ6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
V9GYQ6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
V9GYQ6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
V9GYQ6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
V9GYQ6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
V9GYQ6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
V9GYQ6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
V9GYQ6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
V9GYQ6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
V9GYQ6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
V9GYQ6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
V9GYQ6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
V9GYQ6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
V9GYQ6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms