Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUX4Q9UBX2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUX4Q9UBX2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms