Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms