Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms