Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMSS1Q9BQ75 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms