Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms