Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms