Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW4

PRIMPOL, DNA-directed primase/polymerase protein, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIMPOLQ96LW4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRIMPOLQ96LW4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRIMPOLQ96LW4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRIMPOLQ96LW4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRIMPOLQ96LW4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRIMPOLQ96LW4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRIMPOLQ96LW4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRIMPOLQ96LW4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRIMPOLQ96LW4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRIMPOLQ96LW4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRIMPOLQ96LW4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRIMPOLQ96LW4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRIMPOLQ96LW4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRIMPOLQ96LW4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRIMPOLQ96LW4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRIMPOLQ96LW4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRIMPOLQ96LW4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms