Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

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Length 952 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC7Q8WUI4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC7Q8WUI4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC7Q8WUI4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC7Q8WUI4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC7Q8WUI4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC7Q8WUI4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC7Q8WUI4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC7Q8WUI4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC7Q8WUI4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC7Q8WUI4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC7Q8WUI4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC7Q8WUI4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC7Q8WUI4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC7Q8WUI4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC7Q8WUI4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC7Q8WUI4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC7Q8WUI4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC7Q8WUI4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC7Q8WUI4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC7Q8WUI4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC7Q8WUI4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC7Q8WUI4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC7Q8WUI4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC7Q8WUI4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC7Q8WUI4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC7Q8WUI4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC7Q8WUI4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC7Q8WUI4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC7Q8WUI4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC7Q8WUI4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC7Q8WUI4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC7Q8WUI4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC7Q8WUI4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC7Q8WUI4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC7Q8WUI4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC7Q8WUI4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC7Q8WUI4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC7Q8WUI4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
HDAC7Q8WUI4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HDAC7Q8WUI4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC7Q8WUI4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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