Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACBD4Q8NC06 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms