Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM71DQ8N9W8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM71DQ8N9W8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM71DQ8N9W8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM71DQ8N9W8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM71DQ8N9W8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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FAM71DQ8N9W8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM71DQ8N9W8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM71DQ8N9W8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM71DQ8N9W8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM71DQ8N9W8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM71DQ8N9W8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM71DQ8N9W8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM71DQ8N9W8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM71DQ8N9W8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM71DQ8N9W8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM71DQ8N9W8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM71DQ8N9W8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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FAM71DQ8N9W8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM71DQ8N9W8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM71DQ8N9W8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM71DQ8N9W8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM71DQ8N9W8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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FAM71DQ8N9W8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM71DQ8N9W8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM71DQ8N9W8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM71DQ8N9W8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
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FAM71DQ8N9W8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM71DQ8N9W8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
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FAM71DQ8N9W8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
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FAM71DQ8N9W8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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FAM71DQ8N9W8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM71DQ8N9W8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM71DQ8N9W8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM71DQ8N9W8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM71DQ8N9W8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM71DQ8N9W8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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FAM71DQ8N9W8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM71DQ8N9W8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM71DQ8N9W8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM71DQ8N9W8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM71DQ8N9W8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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FAM71DQ8N9W8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM71DQ8N9W8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM71DQ8N9W8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM71DQ8N9W8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM71DQ8N9W8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM71DQ8N9W8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM71DQ8N9W8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM71DQ8N9W8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM71DQ8N9W8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM71DQ8N9W8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM71DQ8N9W8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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