Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
DTX3Q8N9I9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTX3Q8N9I9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms