Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKAP1Q86WV1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms