Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms