Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HRCT1Q6UXD1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms