Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms